防水保護層的作用主要是起到延緩防水材料的壽命，同時抵抗夏日紫外線侵襲陽光暴曬，冬日抵御嚴寒減緩防水卷材的老化；而不好的地方則是一旦發生滲水漏水修補費力，需要砸掉漏水區域不可直接在漏水點保護層上面做防水，原因就是水分子能通過保護層滲入漏水點，從而達不到修補的目的，大多數結構屋面的施工中，防水保護層都要做，因此金屬彩石瓦也是需要做的。

目前，市場上的防水卷材有很多，砂面卷材or鋁箔面卷材orPE面卷材，這三者的區別在于：砂面卷材增加本身耐磨性；鋁箔面卷材反射太陽光線，延長材料使用壽命；在這兩種防水卷材不需要做防水保護層，因為會影響其本身防水材料反射光線等特性，如果施工規劃做保護層，則可以考慮PE面卷材。